需要关注三点：第一，要关注剔除变应原后的反应。比如患儿可能会对牛奶蛋白过敏，在进行牛奶蛋白回避以后他的腹泻症状是否减轻或者是消失，如果他的腹泻症状确实得到了明显的改善，就可以认为食物过敏的治疗是比较成功的。
另外还要关注是否减轻了他的肠道炎症的反应，还要关注它是否使得消化道黏膜屏障处于一个稳定的状态。如果这三方面都得到了满足，就可以说食物过敏的治疗目的达到了。因为消化道黏膜屏障的稳定是能够使孩子更好的吸收食物，保证他的正常的生长发育，而炎症反应的减轻，也就是会使他黏膜处于一个相对稳定的状态，而使得他消化和吸收功能也更处于一个稳定的状态。
对于食物过敏的治疗主要分为三个部分，一个部分是饮食的治疗，另外还有就是药物的治疗，还有就是对症治疗。饮食治疗由包括了两个部分：一部分是回避过敏原；第二部分是经验性饮食。回避过敏原主要是指的如果发现患儿对某种食物过敏，就要避开这种食物。对于一些经验饮食，主要是指奶粉的一些替代，比如用部分水解蛋白奶粉，深度水解蛋白奶粉和豆奶粉以及氨基酸奶粉来代替牛奶蛋白奶粉，缓解孩子的过敏的症状。
药物治疗实际上来说，大多数药物是对于IGE介导的食物过敏效果可能更好，而以消化系统为主要表现的这种食物过敏，大多数都是以非IGE介导的。这样的食物过敏，用药物治疗的效果并没有得到一个肯定疗效，需要有进一步的研究来证实。像西替利嗪、孟鲁斯特对于以IGE介导的食物过敏，效果要好于非IGE介导的食物过敏。
还有一些对症治疗。比如说像腹泻的患儿，蒙脱石散保护胃肠黏膜，比如有胃食管反流的孩子，会通过一方面饮食治疗，回避过敏原，进行一些奶粉的替代，还要给他用多潘立酮来进行治疗，减轻他的症状。还有一些湿疹的孩子，如果他的湿疹情况很重，也确实和食物过敏有关系。
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